A Confederação rege-se pelos princípios de igualdade, paridade, cooperação, intercâmbio e de concertação de interesses entre as Federações desportivas portuguesas.

A Confederação constitui um instrumento de cooperação, consulta e representação das Federações desportivas suas associadas, quer nas relações com o Estado, nomeadamente com o Governo, a Assembleia da República, as Regiões e as Autarquias, quer com a União Europeia e ainda com Confederações ou outras Instituições Nacionais ou Internacionais.

Através da Confederação, as Federações suas associadas coordenarão os seus interesses, objectivos e iniciativas comuns, sempre no respeito pela autonomia e independência de cada uma.